使用 synbo 包进行化学反应的贝叶斯优化。该技能提供 Python 脚本来设置反应空间，构建描述符，运行优化，下载推荐条件和上传结果。
CRITICAL：BO 优化前提条件
在执行任何贝叶斯优化（synbo）任务之前，您必须按顺序验证以下 5 个前提条件。请勿在所有标准都满足之前继续优化过程：
验证当前环境是否安装了 conda。如果没有，请确认用户安装 Miniconda（参见 reference/installation.md）。检查 synbo_env conda 环境是否存在。如果没有，请创建它；如果存在，请激活它。验证 synbo 包是否安装在 synbo_env 中。如果没有，请运行 pip install synbo
- 工作目录（project_wd）和项目名称（project_name）初始检查
读取技能目录中的 config.json 文件。如果找到 project_wd 和 project_name，请向用户显示项目名称（例如“找到现有项目：[项目名称]”）并使用它们。如果找不到：
停止并提示用户输入工作目录和项目名称。
验证和保存（CRITICAL）：
在收到用户输入后：
验证路径：检查提供的工作目录是否实际存在于本地文件系统中。如果不存在，请告知用户“路径无效/不存在”并提示他们重新输入。
清理和保存：如果路径存在，请清理项目名称（用下划线替换空格和特殊字符）。然后，立即以以下格式更新 config.json 文件：{"project_wd": "xxx", "project_name": "xxx"}。使用此路径和清理后的项目名称来定义所有后续输出的 save_dir。
验证标准反应空间数据是否存在于 project_wd/rxn_space 目录中。如果找不到：
停止并提示用户：“project_wd/rxn_space 目录中缺少反应空间数据。请提供标准反应空间数据。”
验证条件描述符是否存在于 project_wd/descriptors 目录中。如果找不到：
停止并提示用户：“project_wd/descriptors 目录中缺少条件描述符。请提供标准条件描述符，或让我为您自动生成它们。”
验证优化设置文件（例如 optimization_settings.json）是否存在于 project_wd 目录中。如果找不到：
停止并提示用户：“优化指标未定义。请指定要优化的目标指标（例如，产量，ee），以及它们的优化方向（最大/最小），预期数值范围和相对权重（默认 1.0）。”
验证和保存（CRITICAL）：
在收到用户优化目标后，格式化数据并立即将其保存为 project_wd 中的 optimization_settings.json 文件。JSON 文件必须严格遵循以下结构：
{
"reagent_types": ["reagent1", "reagent2", "condition1", "condition2"],
"opt_metrics": ["target1", "target2"],
"opt_direct_info": [
{
"opt_direct": "max",
"opt_range": [0, 100],
"metric_weight": 1.0
},
{
"opt_direct": "min",
"opt_range": [0, 100],
"metric_weight": 1.0
}
]
}
执行块：
您严格禁止在步骤 1 至 4 完全验证和解决之前执行任何初始化（initialize）、优化（optimize）或其他 synbo 任务。
反应空间
当用户需要提供反应空间数据时，他们可以通过以下两种方法提交：
直接输入：直接在聊天中提供相应分子的 SMILES 字符串。
文件上传：提供包含 SMILES 字符串的表格文件。
命名约定：
强烈建议用户为每个分子分配一个特定的名称。如果没有提供名称，您必须使用基于试剂类型的顺序格式自动分配名称：{reagent_type}-1，{reagent_type}-2 等。
数据存储规则：
无论用户的提交方法如何，所有反应空间数据都必须严格格式化并保存到 project_wd/rxn_space 目录中。每个试剂类型必须保存为一个名为 {reagent_type}.csv 的单独文件。CSV 文件必须包含 exactly 两个标题：SMILES（用于 SMILES 字符串）和 name（用于分子名称）。
条件描述符
请参见
reference/get_desc.md
初始化
请参见
reference/initialize.md
优化
请参见
reference/optimize.md
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